Nein, das ist egal, sofern der Vorgang des Upgrades zuvor abgeschlossen wurde.
Aus der Meldung geht nach meinem Verständnis hervor, dass Deine Wiederherstellungspartition sich nicht auf dem Systemlaufwerk befindet. Da sollte sie aber eigentlich sein. Das könnte mal zu Problemen führen, wenn die nicht auf der Systemplatte ist. Ich schließe aus der Meldung, Du willst auf dem Systemlaufwerk C verschlüsseln, aber die Wiederherstellungspartition befindet sich nicht auf dem Systemlaufwerk. Diese gehört aber zum System. Im Falle eines Bedarfs kann Win also unter bestimmten Umständen nicht darauf zugreifen. Also macht Dich Win darauf aufmerksam, soll die wie vorgesehen genutzt werden, sollte sie auf das Systemlaufwerk verschoben werden.
Um diese Partition geht es in der Meldung nach meinem Verständnis
Poste doch mal bitte einen Screen Deiner Datenträgerverwaltung, damit wir Deine Laufwerke und Partitionen sehen können.